Film, ilk saldırıdan 50 yıl sonrası olarak başlıyor. Yani dünyaya bir uzaylı ırkı olan Formicler saldırmış ve bir komutanın fedakarlığı sayesinde savaşı kazanıp uzaylıları geri göndermişiz. Film burda başlıyor. Bu uzaylı ırkının bir gün geri geleceğine inanılıyor ve bu doğrultuda savaşa hazırlık yapılıyor. Çocukların onların taktiğini anlamada daha iyi olduğunu düşünüp bu işe çocukları atıyorlar. Eğitimlerden geçiriyorlar, uzay üssünde. Kahramanımız Ender ise dik başlı bir yapıya sahip. Generalin gözüne giriyor ve general de Ender’in dünyayı kurtarabilecek bir komutan olabileceğine inanıyor. Ender, basamakları hızla çıkıyor ve sonunda daha 13 – 14 yaşındayken komutan oluyor. Emrindekiler de yine aynı yaşlardaki çocuklar.

     Hep beraber simülasyon ortamında savaşa hazırlanıyorlar. En son son bir simülasyon kalıyor. Diğer yandan Ender farklı bir düşünceye kapılıyor: acaba Formicler barış istiyor olabilir mi diye. Son simülasyonu da başarıyla kazanıyorlar. Simülasyonda uzaylıların ana gezegenini yaşanamaz hale getiriyorlar. Bu olaydan hemen sonra öğreniyorlar ki bu son simülasyon aslında gerçek bir savaşmış. Bir türün tamamen yok edilişine öncülük etmişler. Bunu öğrenen Ender ve arkadaşları üzülüyor. Sonrasında da son bir Formic ve yavru kraliçe kaldığını keşfediyor, Ender. Yavru kraliçeye yeni bir yaşam alanı bulacağına dair söz veriyor ve bu sözünü tutmak için uzun bir yolculuğa çıkıyor.